More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3127 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1113    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  41.62 
 
 		 578 aa  346  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 569 aa  344  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  41.26 
 
 		 578 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  43.03 
 
 		 578 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  39.96 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  39.11 
 
 		 576 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  31.91 
 
 		 572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  31.97 
 
 		 575 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  57.02 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 		 552 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  29 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  25.6 
 
 		 558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  25.69 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  25.69 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  26.57 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  23.14 
 
 		 560 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  23.14 
 
 		 560 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  22.76 
 
 		 560 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  49.04 
 
 		 226 aa  87.8  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 231 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  46.02 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  46.02 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  46.02 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  45.13 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.25 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  45.13 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 230 aa  79.7  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  31.11 
 
 		 694 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  45.56 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  38.39 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.07 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.86 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  43.56 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  39.82 
 
 		 218 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  43.27 
 
 		 243 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.81 
 
 		 261 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.71 
 
 		 320 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  43.56 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 215 aa  76.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 236 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.24 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  42 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1725  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.87 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.972471  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.66 
 
 		 669 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  43.27 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1172  OmpA/MotB domain-containing protein  34.03 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  46.15 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.34 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  32.28 
 
 		 544 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  36.52 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  50 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.16 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  42.31 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.86 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  47.5 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  36.63 
 
 		 271 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 428 aa  73.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.5 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  43.52 
 
 		 219 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.83 
 
 		 261 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.83 
 
 		 261 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40 
 
 		 321 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 207 aa  72.4  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  39.6 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  44.87 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.5 
 
 		 607 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  50 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 210 aa  72.8  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  50.68 
 
 		 210 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  50.68 
 
 		 210 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.18 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009436  Ent638_2913  hypothetical protein  29.31 
 
 		 181 aa  72  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 229 aa  72  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 219 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.05 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  33.13 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.6 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>