More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3029 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  71.87 
 
 		 552 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 555 aa  1097    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  45.8 
 
 		 558 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  45.99 
 
 		 558 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  46.2 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  42.96 
 
 		 558 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  34.27 
 
 		 572 aa  193  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  33.54 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  32.27 
 
 		 587 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  27.38 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  27.43 
 
 		 560 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  27.43 
 
 		 560 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  32.99 
 
 		 576 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  26.56 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  32.4 
 
 		 578 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  32.4 
 
 		 578 aa  127  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  32.4 
 
 		 578 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  29 
 
 		 550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 		 569 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 383 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  32.81 
 
 		 510 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.43 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  34.42 
 
 		 215 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  36.72 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.68 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.28 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 260 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.26 
 
 		 209 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.77 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40.35 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  32.96 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.74 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  35.46 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  41.57 
 
 		 631 aa  80.1  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.09 
 
 		 261 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.64 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.09 
 
 		 261 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 169 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.6 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.83 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  37.07 
 
 		 222 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  41.28 
 
 		 233 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.71 
 
 		 364 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 344 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  41.75 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.37 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.98 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.13 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.09 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  40.45 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  36.19 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  29.01 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  39.81 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  45.35 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.66 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  41.9 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.39 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.88 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  40.37 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.84 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.84 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  39.25 
 
 		 222 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 229 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.5 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>