More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3241 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 383 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  65.85 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  63.25 
 
 		 569 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  55.97 
 
 		 573 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  57.02 
 
 		 550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  58.97 
 
 		 578 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  57.38 
 
 		 578 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  58.97 
 
 		 578 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  38.67 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  32.18 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  38.22 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  38.22 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  33.82 
 
 		 465 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  45.99 
 
 		 575 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 587 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  46.77 
 
 		 572 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  31.62 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  36.42 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  35.93 
 
 		 478 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  35.93 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  34.73 
 
 		 477 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 555 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  38.53 
 
 		 454 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  38.53 
 
 		 453 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  42.48 
 
 		 558 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 		 552 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  42.48 
 
 		 542 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  42.48 
 
 		 558 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  35.78 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  35.78 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  35.78 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  43.1 
 
 		 558 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  38.39 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  39.83 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  44.55 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  38.1 
 
 		 890 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  36.63 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  36.63 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  40.59 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.17 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  30.19 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  35.64 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.71 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  38 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  35.64 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.8 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  37.96 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  39.05 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41 
 
 		 707 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  39.6 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  34.75 
 
 		 658 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 224 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 175 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 459 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.64 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  29.17 
 
 		 694 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  39 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  41.56 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.62 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  36.54 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  36.54 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  36.52 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>