48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0805 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  78.56 
 
 		 455 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  77.02 
 
 		 455 aa  673    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  928    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  78.41 
 
 		 455 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  41.01 
 
 		 463 aa  316  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  42.07 
 
 		 471 aa  309  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3135  ImpA-related N-terminal domain-containing protein  42.98 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  37.03 
 
 		 435 aa  243  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  36.59 
 
 		 437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  31.48 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  31.51 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  31.26 
 
 		 450 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  31.59 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  31.47 
 
 		 453 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  31.22 
 
 		 478 aa  176  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  30.79 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  30.48 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  28.79 
 
 		 411 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0015  hypothetical protein  22.55 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  34.51 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  25.18 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  34.51 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  34.51 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  34.51 
 
 		 635 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  34.51 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  35.78 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  34.51 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  34.51 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  35.19 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  34.26 
 
 		 533 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  34.26 
 
 		 533 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2515  hypothetical protein  25.98 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  27.66 
 
 		 518 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  34.31 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  34.58 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  27.18 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  32.35 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  22.71 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  32.43 
 
 		 789 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  30.91 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  27.18 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  33.7 
 
 		 337 aa  46.6  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  27.46 
 
 		 790 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  29.86 
 
 		 527 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  25.66 
 
 		 523 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  24.64 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>