81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0873 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  73.52 
 
 
623 aa  743    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  71.07 
 
 
630 aa  724    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  100 
 
 
598 aa  1146    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  72.41 
 
 
627 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  84.58 
 
 
653 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  84.08 
 
 
635 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  84.58 
 
 
638 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  84.42 
 
 
642 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  32.41 
 
 
789 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  26.4 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  28.14 
 
 
518 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  41.32 
 
 
790 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  26.51 
 
 
518 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  23.67 
 
 
533 aa  97.4  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  27.45 
 
 
533 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  27.45 
 
 
533 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  23.59 
 
 
522 aa  84  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  24.94 
 
 
482 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  24.44 
 
 
467 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  26.79 
 
 
520 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  40.77 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  35.43 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  39.23 
 
 
524 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  32.24 
 
 
533 aa  70.5  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  34.62 
 
 
534 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  28.81 
 
 
527 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  26.67 
 
 
434 aa  64.3  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  32.78 
 
 
470 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  26.67 
 
 
437 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  32.54 
 
 
528 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  36.72 
 
 
470 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3241  ImpA domain protein  32.17 
 
 
478 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1084  ImpA domain protein  32.17 
 
 
478 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  35.71 
 
 
470 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  34.81 
 
 
530 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  31.3 
 
 
477 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  35.61 
 
 
470 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  35.61 
 
 
470 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  29.95 
 
 
488 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  23.53 
 
 
474 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  38.53 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  36.75 
 
 
455 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  39.45 
 
 
455 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  24.23 
 
 
475 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  21.36 
 
 
513 aa  56.6  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
435 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  27.46 
 
 
791 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  27.65 
 
 
337 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 
437 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  31.45 
 
 
479 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  28.48 
 
 
469 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  34.38 
 
 
366 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  31.5 
 
 
462 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  31.5 
 
 
462 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  25.26 
 
 
469 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  27.96 
 
 
487 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  26.89 
 
 
365 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  30.5 
 
 
487 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  26.52 
 
 
487 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  30.3 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  29.63 
 
 
454 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  29.63 
 
 
453 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0805  ImpA domain-containing protein  30.53 
 
 
465 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  31.73 
 
 
369 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.78 
 
 
2397 aa  46.6  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.1 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.29 
 
 
345 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.17 
 
 
439 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  27.96 
 
 
373 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  27.96 
 
 
373 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  27.96 
 
 
373 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  27.96 
 
 
373 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  29.8 
 
 
357 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  29.8 
 
 
357 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  31.73 
 
 
373 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  53.85 
 
 
767 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  31.73 
 
 
373 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  31.73 
 
 
373 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.03 
 
 
373 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>