128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2185 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  100 
 
 		 365 aa  754    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  46.59 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  41.92 
 
 		 373 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  40.82 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  40.82 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  40.82 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  40.82 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  40.82 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  40.27 
 
 		 373 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  40.27 
 
 		 373 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  40.44 
 
 		 369 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  42.09 
 
 		 369 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  40.76 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  40.76 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  40.82 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  41.1 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  41.1 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  40.76 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  42.02 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  31.18 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  34.09 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.68 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  33.52 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  31.55 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.16 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  29.6 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  31.36 
 
 		 362 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  29.31 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  31.03 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  29.84 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.8 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.25 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  28.66 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.91 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  27.36 
 
 		 372 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.88 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  27.3 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  23.95 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  27.71 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  27.67 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  25.31 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.89 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.88 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  25.29 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  31.16 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  23.46 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  25.14 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  24.1 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  24.32 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  25 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  31.4 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  25 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  23.78 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  24.14 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  26.63 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  30.71 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  30 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  33.65 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  31.58 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  33.65 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  33.65 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  33.65 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  33.65 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  33.65 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  33.65 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  33.65 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 518 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1804  ImpA domain-containing protein  28.28 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.579437  normal  0.0143873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  29.37 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  22.22 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  27.97 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  27.97 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  27.97 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  27.97 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  27.91 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  39.66 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  32.52 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2793  ImpA domain protein  31.25 
 
 		 477 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.36 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  30.82 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  25.15 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  32.04 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  28.85 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  32.04 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  30.19 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  28.85 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  28.85 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  30.19 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  23.6 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  23.85 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  40.26 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2906  ImpA domain-containing protein  28.28 
 
 		 471 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  35.23 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  35.23 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.37 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  29.41 
 
 		 789 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  24.32 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  30.22 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  26.89 
 
 		 598 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>