64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2398 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2521  cell wall anchor domain-containing protein  55.35 
 
 		 987 aa  876    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  100 
 
 		 2397 aa  4596    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2573  cell wall anchor domain-containing protein  55.35 
 
 		 987 aa  876    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  27.84 
 
 		 1859 aa  152  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  44.3 
 
 		 2449 aa  110  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0026  sdrF protein, truncation  63.38 
 
 		 85 aa  94.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16331  hypothetical protein  43.97 
 
 		 190 aa  82  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.377957 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  41.67 
 
 		 965 aa  73.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2710  cell wall anchor domain-containing protein  42.86 
 
 		 877 aa  73.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  41.67 
 
 		 965 aa  73.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2654  cell wall anchor domain-containing protein  42.86 
 
 		 877 aa  73.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  48.45 
 
 		 1049 aa  72.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  36.64 
 
 		 1337 aa  71.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  36.64 
 
 		 1337 aa  71.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  37.7 
 
 		 521 aa  68.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  48.65 
 
 		 1153 aa  68.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  48.65 
 
 		 1153 aa  68.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  44.09 
 
 		 450 aa  64.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.07 
 
 		 2402 aa  64.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  38.82 
 
 		 543 aa  63.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  70.59 
 
 		 848 aa  63.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  38.12 
 
 		 3409 aa  62.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  33.91 
 
 		 1128 aa  62  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  38.41 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0783  hypothetical protein  40.22 
 
 		 166 aa  59.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.024345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  38.55 
 
 		 1126 aa  59.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3560  protein of unknown function DUF312  53.19 
 
 		 258 aa  58.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  63.45 
 
 		 623 aa  58.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  35.82 
 
 		 1104 aa  57.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  25.12 
 
 		 340 aa  57.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  19.76 
 
 		 1116 aa  57  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3489  diacylglycerol kinase catalytic region  36.56 
 
 		 541 aa  57  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  68.89 
 
 		 1191 aa  55.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2380  hypothetical protein  20.83 
 
 		 473 aa  55.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484558  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  37.35 
 
 		 653 aa  53.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  36.73 
 
 		 527 aa  53.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  23.12 
 
 		 1341 aa  53.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  33.33 
 
 		 787 aa  52.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0719  cell wall surface anchor family protein  57.89 
 
 		 824 aa  52  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000554603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1713  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  43.1 
 
 		 676 aa  51.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0683683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 		 14916 aa  51.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  24.78 
 
 		 298 aa  50.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  44.07 
 
 		 863 aa  50.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13899  hypothetical protein  41.18 
 
 		 402 aa  50.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2577  cell wall anchor domain-containing protein  37.9 
 
 		 961 aa  49.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2525  cell wall anchor domain-containing protein  37.9 
 
 		 961 aa  49.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  38.78 
 
 		 3242 aa  49.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0352  Peptidase S53 propeptide  41.33 
 
 		 910 aa  48.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2526  cell wall anchor domain-containing protein  38.71 
 
 		 1038 aa  48.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2578  cell wall anchor domain-containing protein  38.71 
 
 		 1038 aa  48.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 970 aa  48.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1205  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  47.47 
 
 		 963 aa  47.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.854661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9256  hypothetical protein  26.19 
 
 		 380 aa  48.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9251  hypothetical protein  24.03 
 
 		 651 aa  48.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  33.65 
 
 		 419 aa  48.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 586 aa  47.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  32.61 
 
 		 746 aa  47.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2297  lipase  28.73 
 
 		 688 aa  47.8  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  29.1 
 
 		 651 aa  47  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  30 
 
 		 482 aa  47  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  43.42 
 
 		 755 aa  47  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3014  hypothetical protein  50 
 
 		 320 aa  46.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4516  hypothetical protein  28.7 
 
 		 263 aa  46.2  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  19.27 
 
 		 754 aa  45.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>