39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23860 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  50.29 
 
 
167 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  42.17 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  45.86 
 
 
257 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  44.12 
 
 
300 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  46.53 
 
 
238 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  47.06 
 
 
175 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  47.06 
 
 
175 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  47.06 
 
 
175 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  46.32 
 
 
175 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  44.68 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  45.59 
 
 
175 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  46.32 
 
 
186 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  42.46 
 
 
226 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  41.38 
 
 
179 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  41.01 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  42.75 
 
 
192 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  43.48 
 
 
195 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  39.77 
 
 
321 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  43.38 
 
 
170 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  42.03 
 
 
172 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  39.89 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  42.34 
 
 
169 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  40.71 
 
 
169 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  39.85 
 
 
170 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  36.69 
 
 
258 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  38.69 
 
 
173 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  43.8 
 
 
162 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  35.97 
 
 
216 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  41.01 
 
 
157 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  34.51 
 
 
194 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  42.14 
 
 
163 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  32.61 
 
 
154 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  35.12 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  38.97 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  34.11 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  34.29 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.72 
 
 
2449 aa  52.8  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  26.26 
 
 
1859 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>