38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  75.82 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  64.67 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  59.32 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  59.32 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  59.32 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  63.19 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  65.41 
 
 		 175 aa  203  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  63.23 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  64 
 
 		 186 aa  192  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  61.21 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  52.26 
 
 		 238 aa  157  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  53.33 
 
 		 321 aa  153  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  51.25 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  49.32 
 
 		 328 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  51.85 
 
 		 295 aa  137  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  47.06 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  54 
 
 		 267 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  45.51 
 
 		 300 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  48.34 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  47.5 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  53.64 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  46.88 
 
 		 195 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  45.32 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  42.03 
 
 		 340 aa  117  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  47.79 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  45.99 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  46.62 
 
 		 226 aa  107  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  45.52 
 
 		 216 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  43.88 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  40.3 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  38.26 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  80.9  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  40.77 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  39.6 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  39.44 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  37.86 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  39.8 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>