39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4058 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  89.14 
 
 
175 aa  300  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  85.23 
 
 
175 aa  299  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  86.86 
 
 
186 aa  290  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  71.62 
 
 
170 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  59.32 
 
 
172 aa  204  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  58.43 
 
 
179 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  70.27 
 
 
162 aa  198  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  61.07 
 
 
173 aa  184  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  51.03 
 
 
328 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  53.42 
 
 
321 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  48.12 
 
 
300 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  49.35 
 
 
238 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  54.48 
 
 
267 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  144  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  48.48 
 
 
169 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  52.08 
 
 
205 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  49.31 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  52.26 
 
 
157 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  47.06 
 
 
340 aa  134  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  43.72 
 
 
192 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  54.07 
 
 
226 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  44.79 
 
 
195 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  49.26 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  48.94 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  42.45 
 
 
154 aa  104  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  39.88 
 
 
194 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  41.01 
 
 
160 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  41.29 
 
 
163 aa  94.7  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  39.86 
 
 
216 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  40.43 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  38.46 
 
 
175 aa  84.3  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  38.85 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  38.62 
 
 
208 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  35.53 
 
 
568 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>