39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4021 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  343  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  49.1 
 
 		 238 aa  154  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  58.09 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  55.86 
 
 		 192 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  54.55 
 
 		 216 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  53.68 
 
 		 321 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  48.18 
 
 		 328 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  50.72 
 
 		 295 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  47.92 
 
 		 300 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  48.99 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  49.65 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  50.35 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  52.17 
 
 		 205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  50.35 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  48.94 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  48.94 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  48.94 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  52.55 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  43.45 
 
 		 257 aa  124  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  52.74 
 
 		 267 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  45.65 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  46.76 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  45.99 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  46.1 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  47.45 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  39.85 
 
 		 340 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  43.07 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  45.99 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  41.72 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  47.45 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  44.53 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  50.37 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  45.83 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  39.72 
 
 		 258 aa  93.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  32.87 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  29.1 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>