38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2161 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  54.49 
 
 
179 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  51.25 
 
 
172 aa  167  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  49.44 
 
 
175 aa  158  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  54 
 
 
238 aa  157  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  49.7 
 
 
173 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  54.25 
 
 
257 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  48.48 
 
 
175 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  48.48 
 
 
175 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  48.48 
 
 
175 aa  153  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  49.01 
 
 
186 aa  150  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  47.44 
 
 
175 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  50.33 
 
 
170 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  49.69 
 
 
321 aa  147  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  52.7 
 
 
295 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  44.91 
 
 
162 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  47.17 
 
 
205 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  53.64 
 
 
267 aa  137  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  45.39 
 
 
167 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  45.64 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  44.3 
 
 
300 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  44.59 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  43.24 
 
 
195 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  40.71 
 
 
340 aa  117  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  51.32 
 
 
157 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  52.52 
 
 
169 aa  114  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  45.99 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  42.54 
 
 
216 aa  104  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  44.93 
 
 
226 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  42.25 
 
 
194 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  41.96 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  45.19 
 
 
175 aa  91.7  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  39.33 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  38.03 
 
 
154 aa  87.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  40.94 
 
 
167 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  43.57 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  33.1 
 
 
258 aa  78.2  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  33.1 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>