55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1054 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  100 
 
 
201 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  31.76 
 
 
255 aa  89  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  31.29 
 
 
172 aa  87.8  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  32.14 
 
 
257 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  35.06 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  34.04 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  31.15 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  31.9 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.37 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  28.92 
 
 
176 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  30.63 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  35.97 
 
 
169 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  35.97 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  33.93 
 
 
328 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  30.6 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  34.34 
 
 
300 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.49 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  34.91 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  27.21 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  30.69 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  26.05 
 
 
158 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  34.34 
 
 
175 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  34.21 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  38.81 
 
 
257 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  27.61 
 
 
195 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  32.32 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  24.86 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  32.32 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  29.93 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  32.32 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  30.15 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  30.3 
 
 
175 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  30.89 
 
 
205 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  32.7 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  30.3 
 
 
179 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  27.78 
 
 
154 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  29.36 
 
 
258 aa  45.1  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  32.26 
 
 
421 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  34.65 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  36.62 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  26.67 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  39.29 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  32.65 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0214  hypothetical protein  26.71 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0195  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386415  normal  0.4903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  32.23 
 
 
169 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  34 
 
 
267 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  35.44 
 
 
159 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  31.61 
 
 
522 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1502  hypothetical protein  21.58 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  32.04 
 
 
167 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  27.56 
 
 
182 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>