37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2568 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  809    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  37.04 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  37.58 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.95 
 
 
190 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  35.48 
 
 
183 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  32.14 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  29.55 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  32.18 
 
 
257 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  38.22 
 
 
187 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  32.89 
 
 
182 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  38.22 
 
 
187 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  35.29 
 
 
165 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  31.18 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  30.54 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  34.39 
 
 
160 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  35.23 
 
 
238 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  35.56 
 
 
162 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  31.14 
 
 
255 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  45.7 
 
 
204 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  33.95 
 
 
159 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  35.44 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  35.96 
 
 
274 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  28.17 
 
 
158 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  36.46 
 
 
184 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  28.05 
 
 
184 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  26.51 
 
 
187 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  33.55 
 
 
201 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.18 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  39.47 
 
 
198 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  43.75 
 
 
187 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  27.27 
 
 
522 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  35.12 
 
 
238 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  35.4 
 
 
154 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  29.3 
 
 
201 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  40.91 
 
 
198 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 
255 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  31.71 
 
 
201 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>