60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3958 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  81.49 
 
 		 281 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  66.3 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  59.18 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  45.03 
 
 		 183 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  60.82 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  61.34 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  52.76 
 
 		 201 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  48.59 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  49.23 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  46.94 
 
 		 197 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  49.73 
 
 		 194 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  47.96 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  48.4 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  39.33 
 
 		 178 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  41.57 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  36.93 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  38.04 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  38.04 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  47.83 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  47.83 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  31.84 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  35.97 
 
 		 190 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  30 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  36.05 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  42.35 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  28.65 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  44.27 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  28.09 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  39.47 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  35.12 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  32.34 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  28.49 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  34.76 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  28.74 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  26.98 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  37.36 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  27.53 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  39.02 
 
 		 162 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  32.21 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  36.14 
 
 		 160 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  37.16 
 
 		 185 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  27.74 
 
 		 163 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  28.06 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  45.12 
 
 		 187 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  36.48 
 
 		 159 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  32.64 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  40.38 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  52 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  32.95 
 
 		 165 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4263  hypothetical protein  36.05 
 
 		 176 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926543 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0919  hypothetical protein  34.91 
 
 		 176 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1093  hypothetical protein  35.09 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.583723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  24.1 
 
 		 170 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  27.75 
 
 		 183 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  31.58 
 
 		 169 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  31.58 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1166  hypothetical protein  34.91 
 
 		 176 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  26.83 
 
 		 164 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>