60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0172 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1134    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  49.6 
 
 		 294 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  49.6 
 
 		 294 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  41.1 
 
 		 312 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  43.97 
 
 		 254 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  37.19 
 
 		 301 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  44.72 
 
 		 292 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9104  hypothetical protein  41.18 
 
 		 126 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0214  hypothetical protein  40.83 
 
 		 163 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3816  hypothetical protein  40.83 
 
 		 163 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.473605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3628  hypothetical protein  38.35 
 
 		 176 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.146456  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1868  hypothetical protein  37.3 
 
 		 152 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  35.03 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  39.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2858  hypothetical protein  37.14 
 
 		 162 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262338  normal  0.333542 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4147  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  45.71 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  30.77 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  48.28 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2150  hypothetical protein  48.65 
 
 		 77 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2393  hypothetical protein  47.3 
 
 		 77 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121974  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  35 
 
 		 407 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  35.56 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  32.71 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.86 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  46.55 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  32.23 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  30.53 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  34.65 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  41.77 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  30.63 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4172  hypothetical protein  44 
 
 		 77 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  34.15 
 
 		 198 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  30.7 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  44.44 
 
 		 238 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  37.31 
 
 		 288 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7281  hypothetical protein  45.31 
 
 		 70 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  43.1 
 
 		 238 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  38.67 
 
 		 197 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4580  hypothetical protein  34.12 
 
 		 151 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  33.62 
 
 		 273 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  24.86 
 
 		 183 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  27.4 
 
 		 288 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  29.91 
 
 		 284 aa  51.2  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2772  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116044  normal  0.0824549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  29.91 
 
 		 234 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1473  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375444  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  32.46 
 
 		 233 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2648  hypothetical protein  40.85 
 
 		 80 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2875  hypothetical protein  40.85 
 
 		 80 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  29.06 
 
 		 233 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0571  hypothetical protein  43.48 
 
 		 93 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  31.82 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  35.29 
 
 		 201 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  36.84 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  35.48 
 
 		 204 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  30.1 
 
 		 287 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  27.97 
 
 		 246 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  36.67 
 
 		 194 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>