21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2393 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2393  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121974  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2150  hypothetical protein  96.1 
 
 		 77 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4147  hypothetical protein  64.38 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1470  hypothetical protein  54.67 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7281  hypothetical protein  53.12 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2648  hypothetical protein  49.35 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2875  hypothetical protein  49.35 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4172  hypothetical protein  49.35 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2772  hypothetical protein  49.35 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116044  normal  0.0824549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  47.3 
 
 		 561 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1473  hypothetical protein  45.45 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375444  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  43.06 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2644  hypothetical protein  50.7 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2359  hypothetical protein  47.89 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.51473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0571  hypothetical protein  48.98 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0272  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4244  hypothetical protein  63.41 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2659  hypothetical protein  37.14 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125976  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3013  hypothetical protein  65 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2631  hypothetical protein  43.14 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3615  hypothetical protein  44.62 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>