45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  100 
 
 		 380 aa  747    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  37.95 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.25 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  48 
 
 		 366 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  47.06 
 
 		 158 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  44.79 
 
 		 248 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  41.67 
 
 		 299 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  45.52 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  34.48 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  40.57 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  47.31 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  41.18 
 
 		 301 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  28.52 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  40.86 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  43.27 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  31.94 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  39.86 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  39.26 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  37.78 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  33.98 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  28.24 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  27.8 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  38.89 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  37.5 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  32.24 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  39.09 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  37.84 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  36.11 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  32.23 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24560  protein of unknown function (DUF2382)  33.1 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  39.81 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  30.63 
 
 		 118 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  39.81 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  28.76 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1455  hypothetical protein  36.89 
 
 		 156 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.340551  normal  0.0784285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  26.92 
 
 		 120 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2858  hypothetical protein  30.33 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262338  normal  0.333542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  31.37 
 
 		 486 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  32.74 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  31.53 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>