43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1657 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  67.92 
 
 
312 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  52.9 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  52.94 
 
 
281 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  49.18 
 
 
280 aa  292  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  51.46 
 
 
292 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  49.84 
 
 
304 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  41.48 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  43.83 
 
 
233 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  50.86 
 
 
119 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  33.87 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  32.03 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  32.26 
 
 
282 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  32.26 
 
 
284 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  44.07 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  41.38 
 
 
234 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  41.38 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  36.36 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  37.17 
 
 
380 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  32.41 
 
 
261 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  33.93 
 
 
152 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  32.41 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  32.41 
 
 
261 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1658  hypothetical protein  35.35 
 
 
181 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.336581  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  36.42 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  42.11 
 
 
123 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  36.84 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1879  hypothetical protein  46.55 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  36.14 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  36.14 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4280  hypothetical protein  32.39 
 
 
111 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  36.28 
 
 
366 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  39.39 
 
 
142 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4686  hypothetical protein  35.14 
 
 
166 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  35.04 
 
 
283 aa  49.3  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  32.26 
 
 
258 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  32.35 
 
 
131 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0250  hypothetical protein  25.5 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  31.52 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  27.03 
 
 
269 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  32.03 
 
 
307 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0276  hypothetical protein  24.83 
 
 
222 aa  42.7  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.257999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>