50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2721 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  98.85 
 
 
261 aa  530  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  98.85 
 
 
261 aa  530  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  51.94 
 
 
277 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  44.4 
 
 
279 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  51.55 
 
 
277 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  41.92 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  42.91 
 
 
259 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  42.69 
 
 
259 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  41.22 
 
 
268 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  41.83 
 
 
269 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  38.22 
 
 
248 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  36.88 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  37.31 
 
 
272 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  36.92 
 
 
272 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  37.12 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  36.29 
 
 
253 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  31.4 
 
 
249 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  35.04 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  32.29 
 
 
152 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  26.85 
 
 
123 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  32.41 
 
 
311 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  29.9 
 
 
131 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  31.58 
 
 
130 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  32.38 
 
 
312 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  31.94 
 
 
142 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  32.71 
 
 
160 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  32.71 
 
 
160 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  30.84 
 
 
161 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  33.64 
 
 
175 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  31.07 
 
 
158 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  32.73 
 
 
175 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 
160 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  29.91 
 
 
160 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 
160 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  30.28 
 
 
163 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  30.28 
 
 
163 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  32.41 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  30.28 
 
 
163 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  30.36 
 
 
158 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  25.41 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  33.66 
 
 
292 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  33 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  24.21 
 
 
119 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  35 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  25.51 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  35.37 
 
 
366 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  29.09 
 
 
169 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>