39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0277 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  95.42 
 
 
284 aa  543  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  80.78 
 
 
282 aa  461  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  47.33 
 
 
288 aa  209  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  31.56 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  31.42 
 
 
324 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  32.16 
 
 
281 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  31.09 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  32.26 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  30.84 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  33.11 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  30.96 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  29.94 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  26.74 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  30.18 
 
 
380 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  37.29 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  37.29 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0250  hypothetical protein  32.47 
 
 
222 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  30.7 
 
 
561 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  36 
 
 
233 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  38.78 
 
 
119 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0276  hypothetical protein  30.97 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  24.28 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2013  hypothetical protein  29.01 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  36.13 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  30.65 
 
 
312 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  36.13 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  23.08 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  34.58 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  25.64 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.09 
 
 
366 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  38.57 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  31.13 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  36 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  40.68 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  35.96 
 
 
400 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  38.98 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  26.81 
 
 
233 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>