28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0521 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 322 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  64.48 
 
 		 300 aa  338  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  62.95 
 
 		 307 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  52.33 
 
 		 301 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  46.62 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  41.7 
 
 		 273 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  41.55 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  37.94 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  37.97 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  56.2 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  36.64 
 
 		 248 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  37.59 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  38.28 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  40.91 
 
 		 380 aa  86.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  38.17 
 
 		 158 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  41.67 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  37.82 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  40.43 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  35.29 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  24.91 
 
 		 288 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  27.56 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0824  hypothetical protein  41.3 
 
 		 117 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  23.96 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  26.18 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  33.65 
 
 		 132 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  24.54 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  37.8 
 
 		 120 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  36.61 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>