29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1041 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  919    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  58.26 
 
 		 295 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  33.68 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  31.63 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  43.55 
 
 		 101 aa  57.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  33.94 
 
 		 300 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  34.02 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  52 
 
 		 110 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.26 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  38.04 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1677  hypothetical protein  39.47 
 
 		 107 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.989943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  38.75 
 
 		 138 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  30.77 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  52.38 
 
 		 104 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  32 
 
 		 287 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  31.37 
 
 		 380 aa  47.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  28.87 
 
 		 273 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0485  hypothetical protein  39.66 
 
 		 132 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  33.7 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  38.33 
 
 		 103 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  41.03 
 
 		 81 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  58.14 
 
 		 85 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0260  hypothetical protein  37.93 
 
 		 178 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3199  hypothetical protein  41.51 
 
 		 106 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000230213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>