49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4690 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  100 
 
 		 301 aa  597  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  48.15 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  51.43 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  51.66 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  45.21 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  50.69 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  46.38 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  45.96 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  42.31 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  41.26 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  39.74 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  68 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  39.8 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  44.3 
 
 		 158 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  45.61 
 
 		 380 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  36.3 
 
 		 145 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  28.47 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  26.74 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  26.74 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  41.27 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  27.37 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  33.61 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  27.74 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  30.63 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  40.91 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  35.71 
 
 		 561 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  40.35 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  40.35 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  32.67 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  34.02 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  27.64 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  32.62 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  38.02 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  38.02 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  33.01 
 
 		 118 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  32.61 
 
 		 263 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  35 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  31.63 
 
 		 169 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  31.31 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  30.53 
 
 		 120 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24560  protein of unknown function (DUF2382)  44.62 
 
 		 160 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  33.67 
 
 		 163 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 163 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 		 160 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  31.71 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  37.29 
 
 		 563 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  28.87 
 
 		 148 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>