42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1878 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  51.94 
 
 
311 aa  301  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  50.48 
 
 
312 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  49.04 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  47.71 
 
 
281 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  47.35 
 
 
280 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  50.65 
 
 
292 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  38.85 
 
 
266 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  34.75 
 
 
233 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  33 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  48.7 
 
 
119 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  31.8 
 
 
282 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  31.42 
 
 
282 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  30.98 
 
 
284 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  40.85 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  39.44 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  39.01 
 
 
233 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  29.7 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  34.07 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  35.14 
 
 
380 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  40.45 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  33 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  36.71 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  26.64 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  37.66 
 
 
123 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  38.21 
 
 
246 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  33.01 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  29.47 
 
 
152 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4280  hypothetical protein  37.88 
 
 
111 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  36.84 
 
 
100 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  36.47 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  34.85 
 
 
131 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  44.68 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  27.3 
 
 
291 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1879  hypothetical protein  47.17 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1658  hypothetical protein  37.18 
 
 
181 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.336581  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.73 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1455  hypothetical protein  35.34 
 
 
156 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.340551  normal  0.0784285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  30.83 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>