25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1999 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  209  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  57.73 
 
 
279 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  42.42 
 
 
277 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  40.82 
 
 
277 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  39.76 
 
 
261 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  39.76 
 
 
261 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  38.55 
 
 
261 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  44.19 
 
 
248 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  35.23 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  32.95 
 
 
258 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  34.83 
 
 
261 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  37.78 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  34.07 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  32.29 
 
 
272 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  35.71 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  31.58 
 
 
272 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  33.71 
 
 
253 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  32.58 
 
 
249 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  36.84 
 
 
324 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  32.35 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  30.88 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  31.11 
 
 
304 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  26.37 
 
 
122 aa  40  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  33.87 
 
 
221 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>