21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3327 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3480  hypothetical protein  53.18 
 
 
229 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4173  hypothetical protein  52.02 
 
 
240 aa  197  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.287297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3331  hypothetical protein  44.34 
 
 
230 aa  173  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1926  hypothetical protein  44.6 
 
 
207 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4405  hypothetical protein  35.38 
 
 
172 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4845  hypothetical protein  27.68 
 
 
222 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2588  hypothetical protein  28.43 
 
 
172 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371628  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3492  hypothetical protein  27.45 
 
 
172 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4536  hypothetical protein  28.44 
 
 
188 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.981585  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  25.97 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  25.97 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  26.27 
 
 
261 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  23.26 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  35.21 
 
 
277 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  25.55 
 
 
268 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  33 
 
 
628 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  24.34 
 
 
269 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  32.39 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  32.88 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>