30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1697 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  90.42 
 
 
259 aa  480  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  90.04 
 
 
259 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  66.67 
 
 
272 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  66.28 
 
 
272 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  65.76 
 
 
269 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  65.25 
 
 
268 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  42.31 
 
 
261 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  45.04 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  41.92 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  44.27 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  41.54 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  40.89 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  42.8 
 
 
248 aa  205  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  41.86 
 
 
243 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  41.09 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  33.2 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  35.6 
 
 
253 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  34.83 
 
 
100 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  39.73 
 
 
142 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  26.27 
 
 
221 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  37.66 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  37.66 
 
 
131 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  30.61 
 
 
292 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  28.41 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  30.33 
 
 
142 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>