25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3899 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  93.38 
 
 		 272 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  66.67 
 
 		 261 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  68.2 
 
 		 259 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  67.82 
 
 		 259 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  57.95 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  55.93 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  40.67 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  41.04 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  36.92 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  34.55 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  36.54 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  36.92 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  38.46 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  38.55 
 
 		 243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  35.07 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  29.75 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  32.22 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  32.29 
 
 		 100 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  32.98 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  28.16 
 
 		 123 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  31.07 
 
 		 130 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  35.53 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  32.5 
 
 		 142 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>