31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0556 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  85 
 
 		 268 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  65.76 
 
 		 261 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  64.2 
 
 		 259 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  63.81 
 
 		 259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  55.93 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  55.43 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  41.13 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  42.86 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  42.21 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  41.83 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  43.12 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  41.44 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  40.15 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  42.03 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  40.7 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  36 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  35.1 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  41.03 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  39.74 
 
 		 131 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  30.19 
 
 		 123 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  37.37 
 
 		 366 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  35.44 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  34.67 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  31.33 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  30.89 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  24.34 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  27.03 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  31.68 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>