21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2564 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  243  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  41.96 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  41.96 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  41.96 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  43.01 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3797  hypothetical protein  38.78 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  32.98 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  32.98 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  36.84 
 
 		 261 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  37.33 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  31.91 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  34.67 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  24.21 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  24.21 
 
 		 261 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  24.21 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  27.27 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  30.26 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  30.26 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  24.32 
 
 		 253 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  31.51 
 
 		 277 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>