48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2309 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  96.03 
 
 
277 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  53.9 
 
 
279 aa  292  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  51.94 
 
 
261 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  51.55 
 
 
261 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  51.55 
 
 
261 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  44.27 
 
 
261 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  44.11 
 
 
259 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  43.73 
 
 
259 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  43.12 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  44.27 
 
 
268 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  39.53 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  40.52 
 
 
272 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  39.56 
 
 
272 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  40.68 
 
 
258 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  37.12 
 
 
243 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  36.13 
 
 
249 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  42.42 
 
 
100 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  34.07 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  39.71 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  35.87 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  43.06 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  28.85 
 
 
123 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  24.55 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  29.79 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  31.4 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  20.22 
 
 
485 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  30.77 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  33.66 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  37.23 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  28.97 
 
 
122 aa  46.2  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  28 
 
 
131 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1926  hypothetical protein  31.58 
 
 
207 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  40.68 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.53 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  29.07 
 
 
380 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  34.44 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  36.59 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  34.07 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  28.16 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3480  hypothetical protein  31.08 
 
 
229 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  38.98 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.52 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  28 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  29.01 
 
 
158 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>