48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1131 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  41.86 
 
 
261 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  41.86 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  41.86 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  40.15 
 
 
269 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  38.8 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  38.61 
 
 
268 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  38.02 
 
 
261 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  36.88 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  36.88 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  34.33 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  35.88 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  37.9 
 
 
248 aa  177  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  34.73 
 
 
277 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  38.55 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  37.4 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  29.39 
 
 
253 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  30.04 
 
 
249 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  35.23 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  22.55 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  34.38 
 
 
152 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  30.48 
 
 
123 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  37.5 
 
 
292 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  35.37 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  34.69 
 
 
130 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  21.72 
 
 
485 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  35.34 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  32.35 
 
 
142 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  26.12 
 
 
160 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  25.89 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  23.26 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  30.7 
 
 
120 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  26.52 
 
 
161 aa  48.5  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  25.37 
 
 
160 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  35.09 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  24.21 
 
 
156 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  25.56 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  25.56 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  25.56 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  31.18 
 
 
135 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  33.65 
 
 
280 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  28 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  24.3 
 
 
158 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  32.26 
 
 
119 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  24 
 
 
175 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  28.04 
 
 
122 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>