52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1986 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  47.37 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  42.17 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  42.11 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  42.8 
 
 
261 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  42.8 
 
 
259 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  42.8 
 
 
259 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  39 
 
 
261 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  39 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  42.06 
 
 
268 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  38.22 
 
 
261 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  41.57 
 
 
258 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  39.53 
 
 
277 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  39.15 
 
 
277 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  37.9 
 
 
243 aa  177  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  38.46 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  38.46 
 
 
272 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  44.19 
 
 
100 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  35.35 
 
 
123 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  31.34 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  32.99 
 
 
131 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  34.45 
 
 
292 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  29.25 
 
 
160 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  30.19 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  27.78 
 
 
166 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  27.36 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  27.78 
 
 
120 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  30.19 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  30.19 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  28.45 
 
 
160 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  27.78 
 
 
165 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  28.97 
 
 
175 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  28.32 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  27.36 
 
 
161 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  29.63 
 
 
163 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  29.63 
 
 
163 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  25 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  26.42 
 
 
166 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  27.36 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  27.36 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  27.36 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3797  hypothetical protein  29.91 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  35.37 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  38.1 
 
 
312 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  33.72 
 
 
119 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  27.78 
 
 
163 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  25.2 
 
 
145 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  21.11 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  18.93 
 
 
485 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>