26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1683 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  93.38 
 
 
272 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  67.43 
 
 
259 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  66.28 
 
 
261 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  67.05 
 
 
259 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  57.95 
 
 
268 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  55.43 
 
 
269 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  39.56 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  37.31 
 
 
261 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  36.92 
 
 
261 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  37.31 
 
 
261 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  39.93 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  38.46 
 
 
248 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  33.09 
 
 
279 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  37.4 
 
 
243 aa  165  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  35.45 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  32.64 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  29.34 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  32.98 
 
 
119 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  36.84 
 
 
152 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  28.85 
 
 
130 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  35.53 
 
 
131 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  32.5 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  29.55 
 
 
123 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  30.83 
 
 
324 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>