32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5572 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  99.61 
 
 
259 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  90.42 
 
 
261 aa  480  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  68.2 
 
 
272 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  67.43 
 
 
272 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  64.2 
 
 
269 aa  331  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  63.57 
 
 
268 aa  327  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  40 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  43.08 
 
 
261 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  42.69 
 
 
261 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  42.31 
 
 
261 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  44.11 
 
 
277 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  44.49 
 
 
277 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  42.8 
 
 
248 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  41.86 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  39.69 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  33.2 
 
 
249 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  35.08 
 
 
253 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  34.07 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  29.59 
 
 
123 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  25.97 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  28.87 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  32.65 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  29.9 
 
 
131 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  27.59 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  19.15 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  19.83 
 
 
175 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  29.73 
 
 
142 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  28.68 
 
 
304 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  30.26 
 
 
119 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  28.44 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>