54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1285 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  45.19 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  47.37 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  36.8 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  36 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  36.15 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  36.29 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  37.76 
 
 		 261 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  35.6 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  33.87 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  35.08 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  35.08 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  32.94 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  32.22 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  32.64 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  33.2 
 
 		 277 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  34.39 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  29.39 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  33.71 
 
 		 100 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  32.08 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  32.71 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  36.11 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 160 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  29.25 
 
 		 131 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  32.26 
 
 		 130 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  28.71 
 
 		 160 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  26.73 
 
 		 161 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  26.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  26.73 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  26.73 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  26.73 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  29.36 
 
 		 142 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  27.68 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  26.88 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  31 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  27.96 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  26.88 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  24.3 
 
 		 122 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  19.91 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  20.83 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  22.63 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  26.73 
 
 		 157 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  29.87 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  25.81 
 
 		 120 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  28.95 
 
 		 148 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  25 
 
 		 175 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  35.9 
 
 		 281 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  31.08 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  24.3 
 
 		 174 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  24.75 
 
 		 158 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>