36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01282 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  45.19 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  42.17 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  35.1 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  33.2 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  36.17 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  33.2 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  31.02 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  31.4 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  31.4 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  31.91 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  31.98 
 
 		 279 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  29.75 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  36.13 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  36.13 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  29.34 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  30.04 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  32.58 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  26.61 
 
 		 123 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  26.36 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  28.26 
 
 		 175 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  26.88 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  20.09 
 
 		 485 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  24.55 
 
 		 131 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  29.03 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  27.17 
 
 		 175 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  28.41 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  28.42 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  25.25 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  19.14 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  24.11 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  28.3 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  28.09 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  28.09 
 
 		 166 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  25.26 
 
 		 166 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>