161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1690 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
156 aa  324  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  66.45 
 
 
158 aa  213  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  63.16 
 
 
158 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  62.33 
 
 
161 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  65.96 
 
 
175 aa  187  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  68.46 
 
 
175 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  68.42 
 
 
169 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  60.27 
 
 
160 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  60.27 
 
 
160 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  62.04 
 
 
160 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  60.27 
 
 
160 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  62.04 
 
 
160 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  65.94 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  70.18 
 
 
148 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  58.99 
 
 
163 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  58.99 
 
 
163 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  58.99 
 
 
163 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  66.96 
 
 
155 aa  171  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  54.93 
 
 
166 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  52.67 
 
 
166 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  52 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  60.15 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  55.73 
 
 
158 aa  155  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  54.76 
 
 
156 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  56.9 
 
 
173 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  50.34 
 
 
163 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  50.34 
 
 
163 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  49.34 
 
 
174 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  54.4 
 
 
156 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  53.03 
 
 
163 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  52.08 
 
 
142 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  52.08 
 
 
142 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  51.37 
 
 
154 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  49.19 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  47.54 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  49.11 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  49.11 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  45.83 
 
 
485 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  44.35 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  47.86 
 
 
140 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  40.44 
 
 
117 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  43.01 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  37.5 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 
131 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  37.5 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  36.61 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  35.51 
 
 
125 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
234 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  35.34 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  35.34 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  33.02 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  34.19 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  35.2 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  37.93 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  36.13 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  39.29 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  34.23 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  32.08 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  33.96 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  35.59 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  40.96 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  36.46 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  33.33 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  33.03 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  29.06 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  37.5 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  32.38 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  33.96 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  37.5 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  34.75 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  34.69 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  33.64 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  38.82 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 
526 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  30.93 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  30.36 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  31.9 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  30.36 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  31.03 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  33.94 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  30.17 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  35.37 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  39.24 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  36.14 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  27.48 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  33.02 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  31.11 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  30.85 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  32.93 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  31.18 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3980  PRC-barrel  42.86 
 
 
125 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4254  PRC-barrel  42.86 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  26.73 
 
 
121 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1248  PRC-barrel domain protein  26.73 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0934  PRC-barrel domain-containing protein  26.17 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.889607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  39.33 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3814  PRC-barrel  38.64 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>