46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  46.81 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  44.44 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  39.31 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  43.34 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  38.2 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  42.69 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  37.29 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  56.9 
 
 		 380 aa  142  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  33 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  37.59 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  36.88 
 
 		 322 aa  138  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  54 
 
 		 366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  42.48 
 
 		 158 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.88 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  30.58 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  32.21 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  28.84 
 
 		 288 aa  72  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  30.3 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  34.65 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  41.07 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  40.18 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  32.71 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  40.18 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  38.1 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  38.26 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  32.65 
 
 		 120 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  38.26 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  36.44 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  37.4 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  37.4 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  26.12 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  24.09 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  25.28 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  34.15 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  28.04 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  35.04 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  29.67 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  34.12 
 
 		 486 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 122 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  28.3 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  36.28 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  29.57 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  25.49 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1455  hypothetical protein  29.51 
 
 		 156 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.340551  normal  0.0784285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  36.25 
 
 		 158 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>