36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0251 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  95.42 
 
 		 282 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  80.57 
 
 		 282 aa  455  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  46.04 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  31.8 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  30.98 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  32.71 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  30.45 
 
 		 280 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  33.78 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  32.26 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  31.02 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  31.38 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  29.94 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  26.74 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  29.41 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0250  hypothetical protein  31.61 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  32.26 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  32.26 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  40.7 
 
 		 119 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  24.26 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0276  hypothetical protein  27.49 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  36.78 
 
 		 233 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  29.91 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  29.84 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  22.22 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  31.82 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  24.03 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2013  hypothetical protein  28.05 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.11 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  32.11 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  32.77 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  37.14 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  32.77 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  38.98 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  34.83 
 
 		 400 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  25.87 
 
 		 377 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>