40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3629 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  91.44 
 
 
301 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  61.69 
 
 
294 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  61.02 
 
 
294 aa  329  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  36.11 
 
 
561 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  38.91 
 
 
312 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  35.18 
 
 
292 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  38.28 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  41.43 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7614  hypothetical protein  41.73 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  43.18 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  34.92 
 
 
183 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  35.85 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  32.08 
 
 
246 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  28.09 
 
 
274 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  38.74 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  37.2 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  38.26 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  39.81 
 
 
380 aa  59.7  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  33.87 
 
 
282 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  34.68 
 
 
282 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  36.76 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  50 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  32.03 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  34.19 
 
 
233 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  31.75 
 
 
234 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  25.94 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  46.3 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  35.96 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  33.93 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  40.28 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3628  hypothetical protein  38.38 
 
 
176 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.146456  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  35.29 
 
 
233 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1868  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  35.59 
 
 
198 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3816  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.473605  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0214  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>