58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3611 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  81.14 
 
 		 274 aa  360  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  62.57 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  55.19 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  44.9 
 
 		 183 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  60.2 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  58.67 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  49.75 
 
 		 201 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  48.02 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  49.05 
 
 		 194 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  45.95 
 
 		 201 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  43.84 
 
 		 198 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  38.92 
 
 		 197 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  44.68 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  36.88 
 
 		 178 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  55.07 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  55.07 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  38.73 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  40.12 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  35.39 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  45.26 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  37.97 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  34.24 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  41.1 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  42.11 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  42.86 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  43.48 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  35.33 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  33.12 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  43.48 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  26.88 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  28.74 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  32.95 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  40.62 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  30.63 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  30.61 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  36.61 
 
 		 185 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  25.95 
 
 		 187 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  37.72 
 
 		 162 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  48.78 
 
 		 187 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  54.72 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  28.29 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  53.7 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  26.73 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  28.85 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  25.84 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  27.59 
 
 		 163 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  32.35 
 
 		 160 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4263  hypothetical protein  38.65 
 
 		 176 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  36.81 
 
 		 522 aa  45.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1167  hypothetical protein  26.78 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  34.94 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  50 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  27.49 
 
 		 164 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0919  hypothetical protein  36.81 
 
 		 176 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1093  hypothetical protein  36.9 
 
 		 176 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.583723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>