31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5410 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1167  hypothetical protein  75.81 
 
 
193 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5439  hypothetical protein  74.59 
 
 
193 aa  260  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2144  hypothetical protein  58.64 
 
 
195 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  hitchhiker  0.000102068 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3034  hypothetical protein  56.19 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0966  hypothetical protein  56.19 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1106  hypothetical protein  56.19 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1111  hypothetical protein  56.19 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0388887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1562  hypothetical protein  56.19 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3012  hypothetical protein  56.19 
 
 
411 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0902  hypothetical protein  55.28 
 
 
358 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5456  hypothetical protein  47.28 
 
 
188 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  47.57 
 
 
197 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2255  hypothetical protein  44.09 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.407095  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3022  hypothetical protein  44.09 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.696592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3151  hypothetical protein  44.09 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1280  hypothetical protein  44.09 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1372  hypothetical protein  44.09 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.363988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1973  hypothetical protein  44.09 
 
 
188 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.139586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0993  hypothetical protein  44.02 
 
 
246 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6052  hypothetical protein  47.31 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0462597 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6460  hypothetical protein  46.77 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.814057  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1369  hypothetical protein  46.77 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0343752  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5636  hypothetical protein  45.36 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0741922  normal  0.0367271 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6384  hypothetical protein  45.36 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  0.650718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5976  hypothetical protein  38.07 
 
 
181 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4379  hypothetical protein  37.29 
 
 
181 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141312  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3988  hypothetical protein  37.29 
 
 
181 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2244  hypothetical protein  36.65 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4243  hypothetical protein  35.75 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998116  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4377  hypothetical protein  44.9 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>