31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6052 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6052  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0462597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1369  hypothetical protein  98.4 
 
 
188 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0343752  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6460  hypothetical protein  98.4 
 
 
188 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.814057  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5456  hypothetical protein  86.7 
 
 
188 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373907 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6384  hypothetical protein  87.23 
 
 
188 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  0.650718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5636  hypothetical protein  87.23 
 
 
190 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0741922  normal  0.0367271 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1973  hypothetical protein  67.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.139586  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2255  hypothetical protein  67.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.407095  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3022  hypothetical protein  67.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.696592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3151  hypothetical protein  67.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1280  hypothetical protein  67.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1372  hypothetical protein  67.02 
 
 
188 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.363988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0993  hypothetical protein  67.02 
 
 
246 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5976  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3988  hypothetical protein  48.89 
 
 
181 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4379  hypothetical protein  48.89 
 
 
181 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141312  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4243  hypothetical protein  51.45 
 
 
181 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998116  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  47.31 
 
 
204 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1167  hypothetical protein  44.51 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5439  hypothetical protein  43.41 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  39.01 
 
 
197 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2144  hypothetical protein  39.67 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  hitchhiker  0.000102068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1111  hypothetical protein  37.82 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0388887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1562  hypothetical protein  37.82 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3034  hypothetical protein  37.82 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0966  hypothetical protein  37.82 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1106  hypothetical protein  35.26 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3012  hypothetical protein  37.82 
 
 
411 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0902  hypothetical protein  36.04 
 
 
358 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2244  hypothetical protein  30.35 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4377  hypothetical protein  45.1 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>