31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5636 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5636  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0741922  normal  0.0367271 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6384  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  0.650718 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5456  hypothetical protein  87.78 
 
 		 188 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1369  hypothetical protein  87.77 
 
 		 188 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0343752  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6460  hypothetical protein  87.77 
 
 		 188 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.814057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6052  hypothetical protein  87.23 
 
 		 188 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0462597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1973  hypothetical protein  65.43 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.139586  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2255  hypothetical protein  65.43 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.407095  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3022  hypothetical protein  65.43 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.696592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3151  hypothetical protein  65.43 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1280  hypothetical protein  65.43 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1372  hypothetical protein  65.43 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.363988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0993  hypothetical protein  65.43 
 
 		 246 aa  227  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5976  hypothetical protein  50.85 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3988  hypothetical protein  49.46 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4379  hypothetical protein  49.46 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141312  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4243  hypothetical protein  52.6 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  45.36 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1167  hypothetical protein  44.51 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5439  hypothetical protein  43.41 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  41.44 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2144  hypothetical protein  39.67 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  hitchhiker  0.000102068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1111  hypothetical protein  39.11 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0388887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1562  hypothetical protein  39.11 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3034  hypothetical protein  39.11 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0966  hypothetical protein  39.11 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1106  hypothetical protein  39.11 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3012  hypothetical protein  38.92 
 
 		 411 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0902  hypothetical protein  37.93 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2244  hypothetical protein  33.51 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4377  hypothetical protein  45.76 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>