30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4379 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4379  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141312  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3988  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5976  hypothetical protein  98.34 
 
 
181 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4243  hypothetical protein  83.43 
 
 
181 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998116  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5456  hypothetical protein  50 
 
 
188 aa  161  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373907 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2255  hypothetical protein  53.76 
 
 
188 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.407095  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3022  hypothetical protein  53.76 
 
 
188 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.696592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3151  hypothetical protein  53.76 
 
 
188 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1280  hypothetical protein  53.76 
 
 
188 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1372  hypothetical protein  53.76 
 
 
188 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.363988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1973  hypothetical protein  53.76 
 
 
188 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.139586  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0993  hypothetical protein  53.76 
 
 
246 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1369  hypothetical protein  49.44 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0343752  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6460  hypothetical protein  49.44 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.814057  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6052  hypothetical protein  48.89 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0462597 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6384  hypothetical protein  49.46 
 
 
188 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal  0.650718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5636  hypothetical protein  49.46 
 
 
190 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0741922  normal  0.0367271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  41.24 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  37.29 
 
 
204 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1167  hypothetical protein  35.8 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5439  hypothetical protein  35.23 
 
 
193 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2144  hypothetical protein  31.84 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  hitchhiker  0.000102068 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1562  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1111  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0388887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3034  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0966  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1106  hypothetical protein  31.66 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3012  hypothetical protein  34.05 
 
 
411 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2244  hypothetical protein  29.02 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0902  hypothetical protein  32.07 
 
 
358 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>