22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0202 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  344  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  43.03 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  44.52 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  38.57 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  28.4 
 
 		 255 aa  67  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  29.41 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  31.29 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  29.7 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.27 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  32.5 
 
 		 421 aa  53.9  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  31.87 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  27.11 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  28.31 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  27.95 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  30.67 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  32.77 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.16 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  21.2 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4197  hypothetical protein  23.78 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  26.83 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>