30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4936 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  100 
 
 		 190 aa  376  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  42.16 
 
 		 522 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.65 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  34.34 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  46.3 
 
 		 425 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  33.74 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  31.18 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  45.73 
 
 		 568 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  31.13 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  27.78 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  33.76 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  36.84 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  31.01 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  30.07 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  30.95 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  27.27 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  31.2 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  36.76 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  36.76 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1115  hypothetical protein  24.67 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000737552  normal  0.471201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  30.63 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  30.57 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  23.81 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  29.3 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4263  hypothetical protein  36.96 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1040  hypothetical protein  35.77 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  26.92 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  28.57 
 
 		 201 aa  42  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  22.92 
 
 		 183 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.913643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>