36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4049 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  52.82 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  46.11 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  51.03 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  52.06 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  38.5 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  42.13 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  44.79 
 
 		 274 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  44.1 
 
 		 281 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  41.34 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  34.95 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  36.56 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  34.42 
 
 		 240 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  35.08 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  33.51 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  34.39 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  27.12 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  35.76 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  32.3 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.99 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.2 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  30.95 
 
 		 561 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  27.95 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  32.32 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  30.82 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  23.57 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  30.82 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  28.57 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  25.44 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  30.19 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  26.23 
 
 		 292 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  23.23 
 
 		 294 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  23.23 
 
 		 294 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  32.89 
 
 		 254 aa  41.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>